来源:《Cell》 发布时间:2017-9-8 15:7:45
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CAPTURE可鉴定DNA系列活性分子

 

中国科学院上海生命科学研究院、复旦大学、清华大学和美国德克萨斯大学的研究人员联合开发出一种新的系统,来鉴定描述控制人基因组中的调节性DNA 序列活性的分子组分,相关研究结果发表在今年8月24 日的《Cell》上。

研究人员开发出一种称作CAPTURE 的新系统,能同时分离基因组序列结合蛋白并研究它们与RNA 和DNA 之间的相互作用。CAPTURE 为研究不同蛋白如何控制癌细胞和干细胞中的基因组功能提供多种可能,这也为发现新的药物靶标提供一种全新的途径。

CAPTURE 方法通过改变CRISPR 基因组编辑系统的用途而被开发出来。CRISPR 系统包括Cas9 蛋白,即一种经向导RNA(gRNA)引导可结合到靶DNA 上的酶。CAPTURE 的工作机制是利用gRNA 将一种失活的Cas9版本(dCas9)引导到研究人员想要研究的DNA 序列元件上, 且dCas9 接受生物素标记。随后,生物素化的dCas9与其他的蛋白、RNA 以及与dCas9 在染色体上的位置相关联的DNA 序列一起,经过链霉亲和素亲和纯化,就能够被

分离出来和接受研究。这使鉴定和描述整个基因组中的调节区域和与这些调节区域结合的蛋白成为可能。

研究人员利用CAPTURE方法成功地鉴定出很多已知的和新的人端粒结合蛋白,他们在人血细胞中发现了调节异常的β- 珠蛋白基因表达的新机制。β- 珠蛋白基因表达变化与遗传性血红蛋白疾病(如镰状细胞疾病)相关联。

《医学科学报》 (第128期 第4版 国际)
 
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